4月1日，日本政府运输省政务次官山村新治郎等官员到达韩国，与“赤军派”成员进行谈判。3日下午3点，全部乘客被释放，山村作为人质登上飞机，一同飞往朝鲜平壤。7点20分，飞机到达平壤，“赤军派”成员被朝鲜拘留，山村和3名机组人员乘“淀号”在4日上午回到日本羽田机场，长达122小时的劫机事件结束。
1970年2月22日，“赤军派”成员为获取资金而袭击千叶县的邮政局。3月15日，“赤军派”议长盐见孝也被捕，其组织处在毁灭状态，但成员继续斗争。日美归还冲绳协定在东京签署的前两天即1971年6月15日，学生组织在明治公园举行抗议集会，“赤军派”成员将钢管炸弹投向防暴警察，造成37名警察受伤。在签署日的6月17日，东京各派学生组织再次举行大规模集会，并与防暴警察发生冲突，“赤军派”成员再次投掷钢管炸弹。
与“赤军派”诞生的同时，另外一个激进组织“京滨安保共斗”组成。其前身是1967年日本共产党与中国共产党对立表面化时，脱离日本共产党的“新中国派”与“共产同”中的一个派别“ML（马克思列宁主义）”以“枪杆子里面出政权”为口号、以毛泽东思想为指导而组成的“日本共产党（革命左派）神奈川县委员会”，下设武装集团“人民革命军”，以京滨地带的工人和学生为中心成员。